Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF3Q92576 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms