Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms