Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms