Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HJURPQ8NCD3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms