Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms