Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA5B2Q8N398 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms