Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPAS3Q8IXF0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms