Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP1Q86WV1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms