Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIBP1Q86W92 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms