Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms