Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HECW1Q76N89 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms