Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIRMAQ69YN4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms