Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM69BQ5VUD6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms