Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms