Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms