Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTDC1Q4AE62 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms