Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms