Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms