Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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RPE65Q16518 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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