Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITSN1Q15811 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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