Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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