Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB39AQ14964 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms