Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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