Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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