Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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