Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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