Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms