Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
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