Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
EIF4EBP1Q13541 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EIF4EBP1Q13541 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms