Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE3BQ13370 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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