Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK5R2Q13319 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms