Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms