Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF6Q13247 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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