Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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IFT88Q13099 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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