Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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