Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
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