Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NPRL3Q12980 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms