Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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