Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2AQ12879 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2AQ12879 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms