Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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