Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK1Q08629 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms