Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLEQ07864 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLEQ07864 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLEQ07864 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms