Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms