Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms