Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms