Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms