Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms