Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OC90Q02509 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OC90Q02509 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms