Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms