Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2BQ00403 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms